“The goal is to create code that addresses challenges in bioinformatics research”
Anfang November war es soweit: Der jährlich stattfindende BioHackathon Europe brachte über 180 Lebenswissenschaftler*innen aus der ganzen Welt vor Ort (und weitere 140 online) zusammen, um in einer knappen Woche an spannenden Projekten zu arbeiten. Das Ziel: Code zu erstellen, der die Herausforderungen der bioinformatischen Forschung angeht.
Wie immer von ELIXIR Europe organisiert, war in diesem Jahr der Campus Belloch in der Nähe von Barcelona Treffpunkt. Im Mittelpunkt der insgesamt 32 Projekte stand die Arbeit an Themen wie FAIR research data, Persistente Identifikatoren, Metadatenstandards, Ontologien und Metadatenkataloge.
Als Vertreter von FAIRagro waren Gabriel Schneider (ZB Med), Julian Schneider(ZB Med), Daniel Arend (IPK) und Daniel Bauer (SGN) insbesondere involviert in die Projekte 19 („Creating user benefit from ARC-ISA RO-Crate machine-actionability“) und 24 („Increasing FAIRness of digital agrosystem resources by extending Bioschemas“). In enger Zusammenarbeit mit Kolleg*innen aus vier weiteren NFDI-Konsortien (NFDI4BioDiversity, NFDI4Earth, DataPLANT und NFDI4Health) wurden hier Metadaten-Standards für FAIRagro Services wie z.B. das FAIRagro Suchportal entwickelt und die Integration von Workflows in FAIRe Digitalen Objekte vorangetrieben.
Außerdem beteiligte sich das FAIRagro Mitglied Claus Weiland (SGN) an Projekt 2 („A curated assessment of metadata descriptors of AI-ready datasets“). Hier wurde die Frage behandelt, wie Rohdaten so mit Metadaten beschrieben werden können, dass sie einfach für KI und deren Training nutzbar gemacht werden können. Das Ziel: den Aufwand und die Zeit, die in die Datenvorverarbeitung für maschinelles Lernen investiert werden, deutlich zu verringern.
Daniel Arend: „Ich bin noch immer begeistert von der engen Zusammenarbeit mit den nationalen und internationalen Kolleg*innen und den zum Teil richtungsweisenden Diskussionen und Ergebnissen. Nächstes Jahr gerne wieder!“
Die Ergebnisse des diesjährigen BioHackathon Europe werden gerade aufbereitet und voraussichtlich noch in 2024 publiziert. Die nächste Veranstaltung findet statt vom 3. bis 7. November 2025 in Berlin.